审计发现，现阶段相当一部分行政事业单位存在财务管理和会计基础工作薄弱，内控制度不健全，风险控制缺位等问题。基本现状是三个缺乏：一是领导缺乏内部控制意识。对建立健全单位内部控制的重要性认识不够，认为可有可无；或简单认为财政的部门预算控制、部门的会计核算片面就等同于内部控制。二是部门缺乏内部控制手段。一些单位的负责人仅把财会部门当成“钱袋子”，会计人员当成“付款员”，财会部门无权参与单位的重要决策乃至业务管理活动，对单位重要决策的过程和结果均不了解。三是会计人员缺乏内部控制能力。在历经自行核算、会计集中核算，国库集中收付及核算后，除极少数单位原保留的会计人员重操旧业，绝大部份的会计人员或退或调转，人员不足，知识老化，缺乏全面财务监管能力，内部控制基本流于形式。基于审计的角度，行政事业单位内部控制制度要得到有效执行，必须加强以下四个环节的控制。
一、收入环节控制
控制点是要确保单位的所有资金流入都在财务掌控中。
（一）严格票据管理。一是必须设立财政票据购领台账，下设收费员的部门还要设立部门票据领销台账，做到来龙去脉清晰，责任划分清楚。二是收款后必须及时缴入财政非税专户，然后会计（或其他指定审核人）凭出纳（或其他收款人员）提交的银行进账单在收据上盖单，以规避大头小尾行为发生。抓住票据这个牛鼻子管好收入第一关。
